Нажмите кнопку «Настройки» в верхней правой части окна для открытия панели настроек сбора.

Речь идет именно о панели настроек в окне запуска сбора статистики или фраз, а не о пункте "Настройки" в главном меню программы.

Например, если вы хотите задать настройки парсинга частотностей (регион и пр.), то необходимо нажать кнопку запуска сбора частотностей и в открывшемся окне запуска нажать "Настройки" в верхнем правом углу окна (по примеру скриншота снизу).

Другими словами, панель настроек находится непосредственно в окне запуска того или иного вида парсинга.